对于食品净化车间的设计与设施要远离有害区域，建筑结构要完善，能满足生产工艺与质量，给排水系统要跟上生产需要，设施要满足要求。污水的排放要达到国家的标准，加工后产生的废弃物远离生产车间，烟道出口和引风机两者间要设置除尘装置，管道与管线尽量集中。冷气管避免在生产线和包装台上通过，不让冷凝水掉入食品中，净化车间内人员占地面积1.5平方米，车间高度为3米左右。对于食品的生产工序必要时应设置水幕和风幕等设备，车间内要保持良好通风，使用机械通风时换气量满足每小时3次左右，机械通风管道距地面2米为宜，并远离污染源与排风口，开口处应设置防护罩，食品净化车间内要有充足的自然采光和照明。消毒池壁内侧与墙体为45度坡型，淋浴室可分散设置。
    食品净化车间要设定卫生管理机构，配备经过培训的专职食品卫生管理人员，建立设备设施维修，做好定期检测，避免食品污染。同时要制定有效的清洗和消毒方法。各种药剂的使用种类和范围要经过卫生监督部门的批准，达标后方可排放，厂区设定的污染收集设施为密封式，要在一定时间内处理，车间内工作人员每年要进行一次体检。对于食品生产过程中的卫生要求，原材料要检验和化验，合格后才能使用，生产设备和工具要在使用前清洗，消毒检测设备时，不能污染食品。包装上的标签要按照相关规定执行，生产过程中的各项原始记录要保存好，保存期应较改产品的商品保存期延长6个月为宜。