无尘室从位置上可以区分为两种建设方法，一种是建设在原本车间的中间，即车间中央放置一个独立的空间，另外一种是直接建设在原本无建筑的位置，背靠原本的建筑。这两类的无尘室都需要注意周边的环境影响，前者受到的原本车间环境的影响，而后者受到的影响更大，且都是来自于外界。
    建立在原本车间之中的无尘室要注意的是原本车间的环境，若是原本的车间的洁净度本来就比较高。那么建立无尘室的过程也会相对简单，建设完成之后对其进行的维护也相对较为简单。
    而建立在室外的无尘室，不仅要应对来自外界的粉尘等污染影响，更在温湿度方面更加不易控制。不仅在建设途中需要花费更多的时间和精力，建设完成之后需要投入的维护和保养费用也是远高于前者的。